在武藏野台地核战争避难所的上面有一座三层铜铎状建筑物。一个保守派大政治家的女婿，也是他的秘书大木勇鱼和5岁的白痴儿子仁住在那儿。他的白痴儿子仁有时不愿活下去，倒地不吃不唱，并猛击自己的头。不久大木勇鱼也陷入这种状态，为了活下去，他们转入核战争避难所。大木在照料儿子的同时，和鲸鱼、树木交感，观察鲸鱼和树木。仁的耳朵非常敏锐，能分辨出五十种鸟的叫声。自称是鲸鱼和树木代理人的大木勇鱼之所以来到核战争避难所生存下去，是因为他认为世界上一切毁灭后，鲸鱼和树木将是地球之王。由中学毕业后成为社会上的落伍者组成的自由航海团，担心世界毁灭时他们将是首当其冲的牺牲者，为了活下去而想逃向大海。大木勇鱼理解他们并同他们交往。但社会上的权势者认为自由航海团是杀人集团，派人把逃到了核避难难所的自由航海团包围了。在枪战之前鲸鱼群听到困在地道里的鲸鱼的声音前来救援。大木本来自以为是鲸鱼和树木的代言人，现在却成了鲸鱼的敌人。他作为告发人类凶残的人，向鲸鱼的魂灵和树木的魂灵倾诉了人类的凶残。在抵抗人类的凶残中自己的肉体——意识将在半空中爆炸，一切皆无。大木勇靠向鲸鱼魂灵和树木魂灵讲述之后便沉入洪水中。